Sci Adv:没有证据支持爬行动物中细菌表观遗传标记的存在

2021-11-01 21:09:02 来源:
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一段话:在早期阶段,物质就开始了在不扭曲微生功用细胞膜DNA该组织顺序的应该下来使其DNA充分发挥不同的的系统,而这就是通过给DNA氨基酸上添加功用理化学记号来实现的。DNA羧酸化是类动功用的关键表征遗传的系统,其中的5-羧酸胞嘧啶(5mc)是最常用的DNA润色之一。6mdA是微生功用限制持续性润色系统会的基本组成成分,现今在类动功用中的忽视已知的限制持续性润色系统会。先前有不少研究成果报道,6mdA也共存于类动功用中的,但并无证据支持者。

近日,在《现代科学困难重重》上的一项研究成果中的,瑞典林雪平大学的研究成果技术人员暗示,类动功用细胞膜中的共存微生功用表征遗传记号很有可能被空气污染了,并且没有足够的证据来证明类动功用中的共存这种润色。

N6-羧酸腺嘌呤(6mdA)是微生功用中的广泛的DNA润色,但最近在类动功用DNA中的也得到了表征。然而,研究成果技术人员写道,即使对来自相同类动功用细胞膜一般来知道的DNA进行的6mdA谱图和丰度测量研究成果也不一致。

为了进一步阐明6mdA在类动功用谱系基准中的的作用,研究成果技术人员利用了体外将人类幼稚T专门设计(NTH)细胞膜并存为TH细胞膜亚群的能力。但是,与先前的研究成果相反,他们找到TH并存每一次中的6mdA的丰度没有全部都是局变化,并且观察到并存的T细胞膜中的的6mdA素质与不曾羧酸化的全部都是基因序列扩增DNA相同,这暗示6mdA并不曾以可检测的素质共存人类T细胞膜中的。

他们还系统持续性了从六个人类细胞膜系中的分离出的DNA中的的6mdA,并鉴定出两个具有高于背景频率素质的6mdA素质的细胞膜系。意想不到的是,两种直接的293T细胞膜系培养功用具有不同的6mdA素质,这暗示研究成果技术人员观察到的6mdA信号并非细胞膜一般来知道本身固有的。确实,当他们进一步看时,他们找到两条6mdA素质升高的细胞膜系被支原体属空气污染,支原体属一种常用的微生功用细胞膜培养功用中的富含6mdA的空气污染功用。当他们用支原体特异持续性青霉素Plasmocin解决问题细胞膜系时,6mdA信号提高为A阴持续性对照。

“我们似乎通过这些技术检测到的6mdA'信号'只是频率。但是,由于一些复杂的技术问题,几种新方法中的的背景频率不是随机的,而是真实信号。”高级著者Colm Nestor(莫罗里斯·内斯特)在一份声明中的知道。

研究成果技术人员系统持续性了如今通过DNA免疫沉淀PCR、质谱和单底物动态PCR在类动功用细胞膜中的定位或检测6mdA的努力。人们找到每种新方法都有局限持续性或缺陷,使表征遗传记号的实为HIV找到率很高,无论如何暗示林雪平研究成果技术人员认为不共存这种现象的证据。

这组著者写道:“我们证明,RNA和微生功用空气污染、抗体交叉反应持续性和其他技术限制的结合已引致6mdA在类动功用DNA中的的反复错误定位。随着DNA和RNA润色家族的促使增长,以及如今不曾知润色的凸显越来越少见,即使用于多种相辅相成新方法,我们也强调了错误找到的有可能持续性。我们建议用于润色和不曾润色的基因序列DNA标准化作为今后对稀有DNA润色的研究成果的最高立即,以及在用于前更全部都是面地验证抗体特异持续性。”

内斯特补充知道,研究成果技术人员在研究成果颇为少见的现象时不必颇为轻轻,选择用于哪种新方法,并考虑他们是否无论如何在衡量共存的事功用。他知道:“如今我们可以或许地知道类动功用中的不共存6mdA。关于6mdA,如果研究成果技术人员停顿研究成果根本不共存的东西,则可以节省大量时间和金钱,并且消除了很多令人失望的事情。”

值得注意出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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